Санаторий «Кисегач» является региональным медико-социальным центром. Более 30 лет в санатории функционирует специализированное кардиологическое отделение, а в 2002 г. открыто специализированное неврологическое отделение для реабилитации лиц с нарушениями мозгового кровообращения. Санаторий «Кисегач» является клинической базой научно-исследовательского института здоровья Челябинской государственной медицинской академии.

Санаторий является высокоспециализированным лечебно-реабилитационным центром. Он принимает постоянное участие в реализации государственных социально-оздоровительных программ, в том числе и в реабилитации лиц, находящихся на экологически неблагополучных территориях.